Sau khi tổ chức lại, Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng các công trình dân dụng sẽ có chức năng làm chủ đầu tư một số dự án đầu tư xây dựng các công trình dân dụng của ngành y tế và các dự án khác sử dụng vốn ngân sách, vốn nhà nước ngoài ngân sách khi được giao; nhận ủy thác quản lý dự án của các chủ đầu tư khác khi được yêu cầu.
Trước đó, Ban Quản lý đầu tư xây dựng các công trình thuộc Sở Y tế TP.HCM là đơn vị đầu mối quản lý nhiều dự án y tế có quy mô hàng nghìn tỷ đồng, như: Bệnh viện Nhi đồng TP.HCM, Bệnh viện Ung bướu cơ sở 2…
