Việc phát hành trái phiếu xanh mang lại nhiều lợi ích hơn cho doanh nghiệp so với các phương thức huy động vốn truyền thống. Đó là vốn vay dài hạn, ít áp lực và đa dạng hóa các nguồn vốn từ hệ thống nhà đầu tư phi ngân hàng. Tuy nhiên, đối với doanh nghiệp Việt Nam, việc tiếp cận với kênh này còn nhiều trở ngại. Đầu tiên là nhiều doanh nghiệp chưa tiệm cận được các tiêu chuẩn kế toán, kiểm toán quốc tế, dẫn tới chưa tận dụng được cơ hội từ trái phiếu xanh. Đồng thời, bản thân doanh nghiệp cũng chưa có sự minh định rõ ràng giữa phát hành trái phiếu và vay ngân hàng.
Qua thực tế triển khai, chúng tôi nhận thấy, có rất nhiều thách thức mà doanh nghiệp phải đối diện khi thực hiện các dự án xanh. Đầu tiên chính là rủi ro tín dụng. Không phải nhà đầu tư nào cũng sẵn sàng chấp nhận mức độ rủi ro của các dự án này do khẩu vị rủi ro của từng nhóm đối tượng là khác nhau. Thách thức thứ hai là sự phức tạp trong quá trình phát hành. So với trái phiếu thông thường, trái phiếu xanh rõ ràng có sự tham gia của nhiều bên hơn: từ tổ chức phát hành, nhà tư vấn, đơn vị kiểm định độc lập cho đến các bên đánh giá khung quản trị. Chính sự phức tạp này khiến rất nhiều doanh nghiệp e ngại phát hành trái phiếu xanh, mà lựa chọn lối đi truyền thống là vay ngân hàng.