Theo quyết định phê duyệt, Dự án được thực hiện trong giai đoạn 2009 - 2016, gồm 4 khối nhà A, B, C, D và các hạng mục kỹ thuật, phụ trợ với thiết kế 5 tầng và 1 tầng mái, trên diện tích đất 11,29 ha, được đầu tư bằng nguồn vốn trái phiếu chính phủ. Chủ đầu tư Dự án là Sở Xây dựng tỉnh Ninh Bình. Dự án đã thực hiện lựa chọn nhà thầu cho 6/6 gói thầu vào cuối năm 2009. Tháng 6/2013, UBND tỉnh Ninh Bình phê duyệt điều chỉnh giảm quy mô Dự án xuống do nhu cầu đào tạo sinh viên trên địa bàn giảm mạnh, chỉ còn 549,4 tỷ đồng, diện tích sử dụng đất giảm còn 2,39 ha. Dự án sau đó cũng bị giãn hoãn, dừng thi công từ năm 2015 do thực hiện Chỉ thị số 1792/CT-TTg ngày 15/10/2012.
UBND tỉnh Ninh Bình cho biết, phần đất còn lại trong khu đất 11,29 ha của Dự án được phê duyệt sử dụng cho 2 dự án khác với thời gian thực hiện 2014 - 2016. Thứ nhất là Dự án Xây dựng nhà ở xã hội (cho các gia đình nghèo, gia đình chính sách và cho người có thu nhập thấp) với tổng diện tích đất 2,08 ha, tổng mức đầu tư 598,72 tỷ đồng (sử dụng nguồn ngân sách Tỉnh). Thứ hai là Dự án Xây dựng cơ sở hạ tầng phục vụ đấu giá quyền sử dụng đất với tổng diện tích 6,79 ha, tổng mức đầu tư 94,9 tỷ đồng (sử dụng nguồn vốn từ nguồn đấu giá quyền sử dụng đất).
Theo UBND tỉnh Ninh Bình, Dự án Khu ký túc xá sinh viên đã được phân bổ và giải ngân 390 tỷ đồng từ nguồn vốn trái phiếu chính phủ; khối lương nghiệm thu, quyết toán vốn đầu tư đã được Kiểm toán Nhà nước khu vực XI tiến hành kiểm toán năm 2018 là 525,917 tỷ đồng; giá trị nợ đọng xây dựng cơ bản là 135,551 tỷ đồng.
Khó khăn, vướng mắc của Dự án bắt nguồn từ việc không được bố trí vốn trái phiếu chính phủ theo tổng mức đầu tư được duyệt. Tháng 5/2022, Bộ Xây dựng đã rà soát và đưa Dự án vào danh mục dự án thu hồi vốn trái phiếu chính phủ với lý do thi công dở dang và hiện không có nhu cầu về nhà ở cho sinh viên. UBND tỉnh Ninh Bình sau đó có văn bản đề nghị Bộ Xây dựng xem xét lại kết luận trên và xem xét phương án xử lý theo hướng chuyển đổi một phần Dự án trên cơ sở tiếp tục hoàn thiện công trình để có thể đưa vào sử dụng giai đoạn tiếp theo (sử dụng nguồn vốn ngân sách tỉnh Ninh Bình).
Lãnh đạo Sở Xây dựng Ninh Bình cho biết, để tránh lãng phí đầu tư, sau khi sáp nhập, Lãnh đạo Tỉnh đã phê duyệt đầu tư Dự án Xây dựng khu nhà ở công vụ tỉnh Ninh Bình trên cơ sở hoàn thiện 2 tòa nhà B, C và các hạng mục hạ tầng kỹ thuật ngoài nhà của Dự án Khu ký túc xá sinh viên tập trung tỉnh Ninh Bình để phục vụ nhu cầu về nhà ở cho cán bộ, công chức, viên chức, người lao động sau sáp nhập tỉnh và chính quyền địa phương 2 cấp. Dự án có tổng mức đầu tư gần 211 tỷ đồng, sử dụng ngân sách tỉnh Ninh Bình, tọa lạc tại phường Hoa Lư, tỉnh Ninh Bình, dự kiến sẽ hoàn thành trong năm 2026.
Lãnh đạo Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình dân dụng và công nghiệp tỉnh Ninh Bình chia sẻ, UBND Tỉnh yêu cầu sớm hoàn thành Dự án để tránh lãng phí nguồn lực đã đầu tư và tăng cường quỹ nhà ở cho cán bộ, công chức, viên chức, người lao động có nhu cầu sau khi sáp nhập 3 tỉnh Nam Định, Ninh Bình và Hà Nam. Hiện nay, Ban đang đẩy nhanh các thủ tục pháp lý để sớm triển khai thi công, hoàn thiện và đưa công trình vào sử dụng, đáp ứng nhu cầu cho cán bộ, công chức, viên chức, người lao động.