Trong kết luận thanh tra hành chính Trường Đại học (ĐH) Kinh tế quốc dân (từ năm 2017 đến 2019), Bộ GD&ĐT chỉ ra nhiều sai phạm, tồn tại liên quan việc đảm bảo quyền lợi cho người học, tuyển sinh đại học, sau đại học của trường này.