Theo lịch trình, tàu SE5 xuất phát tại ga Hà Nội lúc 9h và đến ga Sài Gòn lúc 20h30 ngày hôm sau. Tàu SE6 xuất phát tại ga Sài Gòn lúc 9h và đến ga Hà Nội lúc 20h30 ngày hôm sau.
Dù được nâng cấp, nhưng các đoàn tàu mới này có giá vé không đổi so với giá vé tàu hỏa thường ngày.
